AVISO: Se você nunca jogou esse game ou ainda não chegou ao final do jogo, por favor não leia o texto abaixo para não estragar a surpresa. Esse texto foi escrito para quem não entendeu ou tem alguma dúvida sobre o que acontece no final.
Sonic ficou sozinho para enfrentar Robotnik em sua fortaleza voadora. Depois de se infiltrar pelas defesas inimigas, nosso herói se encontra face a face com seu arqui-inimigo que se protege atrás de um escudo de energia e ataca Sonic com poderosos raios laser. Esquivando-se habilmente, Sonic consegue atacar a base do laser e destruí-lo. Na mesma hora Robotnik pega seu avião e resolve fugir. O Tornado foi atingido por disparos e não há mais como Sonic continuar a batalha… ou será que há?
Tails usou sua habilidade com máquinas e consertou o Tornado! Não só isso, ele também instalou um foquete embaixo dele para poder enfrentar Robotnik de igual para igual. A perseguição então continua pelos céus mas eles sobem cada vez mais alto e se aproximam do espaço sideral. Nem mesmo com as melhorias de Tails o Tornado pode acompanhar Robotnik até o espaço, então Sonic é obrigado a pular e agarrar-se com todas as suas forças ao avião do Robotnik. Eles então chegam ao seu destino: o Death Egg!
Não há anéis aqui nessa enorme nave de batalha e qualquer golpe será fatal!
Logo que chega ao Death Egg, Sonic é atacado por uma versão robótica de si mesmo criada pelo Dr. Robotnik. Silver Sonic tem espinhos metálicos que giram o tempo todo como serras afiadíssimas. Mas esse robô pesado não é páreo para a agilidade e velocidade de nosso herói que consegue então vencê-lo.
Robotnik decide então acabar com seu rival pessoalmente a bordo de um robô gigante! Sonic precisa usar toda sua velocidade para desviar dos ataques do Robô e tomar muito cuidado pra não ser morto por suas garras em forma de espinhos. A batalha é longa e são poucos os momentos em que Sonic consegue uma brecha pra conseguir atacar. Então Sonic finalmente vence o ciêntista do mal mas tudo começa a explodir e o ouriço então precisa correr pra fora dali.
A enorme explosão é vista por todos, inclusive por Tails que está preocupado e decola com o Tornado atrás de seu herói.
Sonic consegue escapar vivo do Death Egg e voa em segurança ao lado de Tails graças as 7 Chaos Emeralds que o transformaram em Super Sonic!
