O protótipo ou versão beta é aquele jogo incompleto usado apenas para divulgação. Até hoje ninguém encontrou um desses cartuchos do Sonic 1 daquela época pra poder mostrar ou transformar em ROM de emulador. Tudo que se tem é o registro feito de revistas antigas que tiveram a oportunidade de fotografar e comentar sobre o que viram. Seguem agora algumas diferenças e curiosidades notadas no Sonic Beta:
• Na tela-título havia a mensagem “Press Start Button”.
• Na parte superior da tela onde está escrito RINGS, no protótipo está apenas RING.
• Ao invés de sair da tela no final de cada etapa, Sonic pulava e dava um soco no ar comemorando.
• Uma versão bem mais antiga do protótipo, mostra uma outra Green Hill Zone, com céu mais escuro, montanhas diferentes no fundo e uma placa de boas vindas (Welcome).
• A Marble Zone tinha uns O.V.N.I.s no céu. Esses objetos podem ser vistos no filme Wayne’s World (em português, Quanto Mais Idiota Melhor) durante o comercial do Noah’s Arcade. Algumas fotos do Sonic são mostradas ao fundo enquanto ele fala para a câmera. Além disso essa fase tinha Badniks que só aparecem em outras fases, como o Yadrin, e também tinha espinhos móveis laterais semelhantes a aqueles que descem do teto.
• Durante a Green Hill Zone existiam esferas iguais aquela usada por Dr. Robotnik para atacar o Sonic no final da 3ª etapa da Green Hill Zone. Ainda não se sabe exatamente qual seria sua utilidade, aparentemente Sonic pegaria uma “carona” em cima dela pra alcançar itens no alto das árvores. Outra teoria diz que esssa esfera deveria perseguir Sonic como se fosse numa cena de Indiana Jones, mas essa idéia só foi usada em Sonic Adventure.
• Spring Yard Zone tinha o nome de Sparkling Zone e tinha um cenário diferente no fundo. Em uma das fases, havia uma placa desejando boa sorte (Good Luck).
• Scrap Brain Zone era um pouco diferente e tinha o nome de Clock Work Zone, mas devido a ausência da letra “W” na fonte dos Title Cards as fotos dessa fase mostram o nome “Clock ork Zone”.
• A ordem das fases no cartucho beta era a seguinte: 1º Green Hill Zone, 2º Labyrinth Zone, 3º Marble Zone, 4º Star Light Zone, 5º Sparkling Zone e 6º Clock Work Zone.
• Existe um Badnik que foi mostrado nas revistas da época mas que não aparece em nenhuma fase da versão final. Ele foi encontrado hackeando o cartucho e é um tipo de coelho chamado Splats.
